Na Debian.org mailing listi osvanulo je upozorenje da sustavi opremljeni Intelovim Skylake i Kaby Lake procesorima "u pojedinim situacijama mogu pokazivati opasno i neobično ponašanje kada je hyper-threading aktiviran".
Kada je u pitanju to "opasno i neobično" ponašanje, Henrique de Moraes Holschuh s Debian.org navodi kako bi aktivan hyper-threading mogao dovesti do nestabilnosti aplikacija i sustava te gubitka podataka, što su naravno ozbiljni problemi kada u pitanje dolazi uporaba računala.
Debian tvrdi kako za rješavanje tog problema postoji jednostavno rješenje - isključivanje hyper-threadinga.
Procesori s gore opisanim problemom uključuju Core seriju procesora za desktop i laptop računala, kao i Intel Xeon procesori.
Bitno je napomenuti kako problem s hyper-threadingom ne zahvaća isključivo korisnike Linux operativnog sustava, već i druge OS-ove, uključujući Windows i Mac OS.